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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

陈建仁陆续公布台新行政机构成员名单，媒体人赵少康批：新瓶装旧酒******

　　【环球网报道】据台湾中时新闻网28日报道，台行政机构即将改组，但任内争议不断的“农委会”主委陈吉仲、“卫福部长”薛瑞元与“经济部长”王美花都留任，对此，台“中广”董事长赵少康28日批评称，光有陈、薛两个成员，“内阁”根本与原来一样，“新瓶装旧酒，还是个‘斗鸡内阁’”。

　　报道称，赵少康提到，王美花的留任也很好笑，宣称是为了继续发展绿能，但台电、中油去年共亏损5000亿元(新台币)，今年还会亏更多，但还可用20年的第二核能发电厂二号机3月14日就要被民进党除役，“这样的浪费民脂民膏，虽然蔡英文是罪魁祸首，但‘经济部’为虎作伥的表现难道没有责任？”

　　赵少康批评称，蔡英文蔡嘴巴说团结，光是留用陈吉仲、薛瑞元，就知道她口是心非，根本没有要和解、团结的意思；这个拖拉、拼凑组成的“内阁”，看不到蔡英文败选后任何检讨改革的诚意，看到的只是争夺权利、自我保护的丑态毕露。

　　据中时新闻网报道，台“立法院”国民党团书记长李德维也批评表示，民进党当局用人仍旧不考量专业，仅考虑民进党内派系分配与平衡，整个“内阁”人事如同儿戏，“什么人都敢用”。李德维说，林右昌仅担任过30万余人口的基隆市长，没有“部会”负责人及民代经历，竟可担任“首席部长”；陈吉仲则有开放莱猪(含莱克多巴胺的美国猪肉)争议，还对蛋价与农渔产品无法输入大陆问题束手无策，薛瑞元护航“高端(台湾自产疫苗)”也受到质疑，两人表现竟“争议越大、官位越稳”。

　　据媒体此前报道，蔡英文1月27日召开记者会，正式宣布将由前副手陈建仁接替苏贞昌担任行政机构负责人，陈建仁27日晚间在脸书公布首波新任“阁员”名单，不过媒体人黄扬明看完名单后发现新面孔仅约九分之一，黄扬明讽刺，“只是换个‘院长’门面而已”。

　　28日，陈建仁又在脸书宣布第二波“内阁”改组人事，包括内务部门负责人由基隆市前市长林右昌接任、文化部门负责人由史哲接任。对于第二波人事变动，有岛内网友表示，每一个任用都好怪，真的是没人啦。(环球网)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）