提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
宁夏电诈案件发案数降至近5年最低值******
中新网银川1月10日电 (记者 杨迪)1月10日是第三个中国人民警察节。当天,宁夏公安厅召开新闻发布会。记者从发布会上获悉,2022年宁夏电信网络诈骗案件发案数下降至近5年来最低值,人民对公安机关执法满意度达91.34%。公众安全感连续13年保持在90%以上。
据介绍,2022年宁夏公安打击犯罪成效更加凸显,共打掉恶势力犯罪团伙4个,刑事案件发案数连续三年下降,命案破案率96.6%,“八类”主要刑事案件破案率96.8%,“两抢”案件破案率100%,电信网络诈骗案件发案数下降至近5年来最低值,未发生重特大道路交通和治安灾害事故。
此外,针对公众关注的热点问题,宁夏公安深入推进“昆仑2022”专项行动,侦办食药环案件125起,涉案金额3.58亿元;严惩破坏生态环境犯罪活动,侦办环境污染领域刑事案件同比上升42.9%;破获涉企案件174起,挽回经济损失1.03亿元;深化“365天×24小时”公安政务服务受理办理机制,公安窗口非工作日办件同比增长30%;协调出台39条便民利企举措,升级“宁警通”功能,实现“无犯罪记录证明”等7个事项全程网办,公安交管互联网综合服务排名全国第3位。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)