点击右上角
微信好友
朋友圈
请使用浏览器分享功能进行分享
提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）厂房建到家门口 山西上党延伸乡村产业链条赋能乡村振兴******
中新网长治2月3日电 (李庭耀 赵彦杰)剪菇柄、烘干、筛选、清洗……春节期间，山西省长治市上党区西火镇梁家庄村“西火三农”干香菇加工基地，村民们分工明确忙着进行干香菇加工。厂房建到家门口，当地延伸乡村产业链条，赋能乡村振兴。
在修剪车间，村民牛燕花正在对鲜香菇剪柄。“厂房建到家门口，反正在家也是闲着，我就和其他村民一起来这里上班。”她告诉记者，除了剪菇柄，自己还负责把香菇放入空气能热泵烘干机进行烘干，每天能挣70元。
面对资源匮乏、人口流失等问题，如何带动村集体经济发展？如何赋能乡村振兴？西火镇探索成立“西火三农”农村集体经济平台公司，以“公司+经济合作社+社员”的发展模式，在镇党委、政府指导下运营管理，由全镇30个农村经济合作社组成，24508名农村经济合作社社员间接持股。
香菇正在被烘干。 赵彦杰 摄2022年，这家公司通过网络直播等手段，推广当地特色农产品，为西火镇东庄村的红薯粉条、北大掌村的香菇、东火村的花生、庄子河村的大樱桃取得了更多订单。
山西老西火三农服务管理有限公司负责人赵志军介绍，依托西火镇北大掌村旺源种植专业合作社香菇菌棒规模化生产的产业基础，该公司在去年延伸乡村产业链条，打造“西火三农”干香菇加工基地。
“干香菇加工基地的建成，既解决了合作社鲜香菇储存时效短的问题，又提高了香菇的附加值。”旺源种植专业合作社负责人王赟说。
“西火三农”干香菇加工基地可以带动周边四五十名村民打工增收。 赵彦杰 摄赵志军告诉记者，每5斤鲜香菇可以生产1斤干香菇，“西火三农”干香菇加工基地可年产干香菇10万斤，产值可达500万元，“不仅能带动周边四五十名村民打工增收，更能促进村集体经济发展”。
“新的一年，我们计划为周边村民提供菌棒和技术指导，带动更多人种植香菇，将产业做大。”赵志军表示，接下来，“西火三农”干香菇加工基地还将生产香菇酱等产品，提高附加值，带动村民增收和村集体经济发展。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
y39彩票地图 |
)